En 1856, el 100 º aniversario del nacimiento de Mozart, una asociación se fundó con el objetivo de crear una escuela de música, con una biblioteca, archivos y sala de conciertos, dedicado a Mozart. Varios edificios de la zona centro de la ciudad de Salzburgo fueron considerados y finalmente se decidió a comprar el chalet del ex ministro del Interior, Josef von Lasser, en el Schwarzstrasse. Trabajos de conversión tuvo lugar desde 1910 hasta 1914 de acuerdo con los planes elaborados por Richard Berndl. El estilo predominante es el historicismo característica tardía de Munich, y detalles elegantes se combinaron con elementos de la tradición barroca locales, art nouveau y arte patriótico edificio. En 1917 la Junta de Gobernadores de la Fundación Internacional Mozarteum elegido Bernhard Paumgartner unanimidad como director de lo que era en ese momento un conservatorio. Esta tarde se convirtió en una academia y luego la Academia Mozarteum de Música y Arte Dramático, y mientras tanto se ha logrado el estatus de universidad. Durante el período en que Paumgartner era director, este instituto educativo experimentó un gran auge: en particular, varias producciones de teatro musical se llevó a cabo en relación con el "Mozarteum Opera Series" y fue gracias a su iniciativa de que estas actuaciones se llevaron a cabo en la ciudad de Salzburgo Teatro (ahora el Landestheater). 

Los problemas financieros de la Fundación Internacional Mozarteum fueron compensadas por la nacionalización de la parte de enseñanza de trabajo de la fundación en el año 1922 con el resultado de que hoy en día existen dos órganos sociales completamente distintas. La Universidad Mozarteum tiene en el ínterin se trasladó la mayoría de sus departamentos en un edificio propio en la Mirabellplatz. 

La Fundación Internacional Mozarteum ha cooperado estrechamente con el Festival de Salzburgo desde 1921: el Gran Salón del Mozarteum es una de las sedes principales de la serie de conciertos sobre todo porque es excelente para la interpretación de música de cámara. Los Mozart S. matinal, conciertos matinales dadas en los fines de semana durante el Festival de Salzburgo, se introdujo por Bernhard Paumgartner y tienen entretanto asumió el estatus de leyenda. En 1930 se celebraron los primeros cursos para la realización y los instrumentos musicales y la iniciativa más tarde se convirtió en la Academia Internacional de Verano del Mozarteum. Cada año los profesores de renombre se reúnen con estudiantes de música entusiastas de todo el mundo para entrar en un diálogo artístico animado.